武汉水上马拉松由国家体育总局游泳运动管理中心、中国游泳协会、武汉市人民政府和湖北省体育局主办，武汉市体育局、武汉东湖生态旅游风景区管委会、武汉旅游体育集团承办，武汉市社会体育指导中心和武汉国际体育赛事管理有限公司共同执行。赛事设有10公里百人专业竞技游和千人方队健康游活动。